갈등 원인 풍납토성 보존·관리 계획은 인근 주민의 재산권 행사와 정주 환경, 이주 대책에 영향을 미친다. 2023년 종합계획 수립 과정에서 주민 의견 반영 여부를 두고 유관 기관 간 이견과 갈등이 있었다.
추진측 입장 서울시는 주민협의체 의견을 공식 검토하고 이를 국가유산청 종합계획과 서울시 시행계획에 반영할 수 있도록 제도를 정비한다. 주민 의견과 정책 반영 추진 상황을 시의회에 보고하고 협의체 운영도 지원할 계획이다.