갈등 원인 종묘 앞 세운4구역 재개발의 건물 높이가 당초 합의된 71.9m에서 145m로 변경되면서 세계유산 경관과 개발을 둘러싼 갈등이 발생했다. 세계유산영향평가 실시 여부와 사업 인허가의 적정성도 쟁점이다.
현재 상황 국가유산청은 무단 시추를 이유로 SH를 경찰에 고발하고 세운4구역에 착공 불가 결정을 내렸다. 현재 국가유산청은 국토교통부에 인가 취소를 요청한 상태이며, 국정감사에서도 여야 간 공방이 이어졌다.