갈등 원인 사업구역 안에 있는 무악재성당은 기존에 성당을 존치하고 사업에서 제외해 달라고 요청해왔다. 조합은 이전 신축과 보상 방안을 제안했으며, 성당은 이전을 전제로 기존 공원 부지를 종교 부지로 변경해 달라고 요구했다.
추진측 입장 조합은 성당 이전을 전제로 종교용지와 총 85억여원의 보상 방안을 제시했다. 성당의 요구를 반영해 공원 부지를 종교 부지로 설계 변경하는 방안을 검토하고 구청 등과 협의할 방침이다.
현재 상황 성당이 보상 방안에 이의를 제기하고 종교 부지 변경을 요구하면서 양측은 본격 협상에 들어갔다. 설계 변경에는 인허가가 필요해 조합은 서대문구청 및 서울시와 협의할 예정이다.